iva intracomunitaria

Aiutoooo....
mi servirebbe un aiuto per quanto riguarda un acquisto intracomunitario effettuato da un soggetto, contribuente iva in italia, con un soggetto "pare" contribuente iva in spagna. Pare perchè nella fattura non è presente la partita iva e la conferma mi è stata data dal sito dell'agenzia delle entrate dove inserendo il presunto codice mi dice che non è presente. A questo punto mi trovo in difficoltà perchè, se registro la fattura e presento l'intrastat la dogana può farmi una verifica e multarmi perchè il soggetto scritto non è presente, se non lo faccio sono in multa lo stesso. A questo punto non avendo nella fattura il codice iva ho inteso l'acquisto come fatto da un soggetto privato intracomunitario siccome sono in tilt essendo al di fuori degli scambi cee registro la fattura art. 7 comma 4 lettera d?
Grazie