Mancata registrazione contratto di locazione ma imposta registro gia' pagata

[giulyrob]

Buongiorno a tutti, ho bisogno di voi per risolvere questo problema:

un cliente (proprietario) ha stipulato e firmato assieme all'inquilina in data 1 settembre 2012 un contratto di locazione ad uso abitativo 4+4 per un canone di euro 4800,00 annui. Il 28 settembre 2012 ha regolarmente versato, tramite il modello F23 allora vigente, l'imposta di registro di euro 96,00. Non ha però mai registrato il contratto all'Agenzia Entrate. Oggi è venuto in studio dicendo che doveva versare (entro il 30 settembre) l'imposta di registro (annualità successiva) per il periodo 1.9.2015 - 31.8.2016 ma mi sono appunto accorta che non ha mai registrato. Cosa si può fare ora? E' ancora possibile registrare adesso questo contratto (tre anni dopo l'inizio effettivo) pagando le relative sanzioni e gli interessi oltre all'imposta di bollo? Come vanno calcolati? Se registra adesso deve obbligatoriamente avere il certificato energetico ed inserire apposita clausola nel testo del contratto?
Se invece decidesse di stipulare oggi un nuovo contratto (magari optando per la cedolare secca) e registrarlo con decorrenza ad esempio 1 ottobre, è ancora in tempo a chiedere il rimborso all'agenzia entrate per la somma già versata nel 2012 e mai utilizzata?
Secondo voi qual'è la soluzione migliore tenendo conto che nel frattempo il proprietario nella dichiarazione dei redditi ha sempre dichiarato il canone percepito e la conduttrice ha versato sempre tramite bonifico bancario?
Vi ringrazio per l'attenzione, buona giornata

[Lucilla78]

Per quanto ne so, le sanzioni per la ritardata presentazione della registrazione oltre l'anno sono del 120% dell'imposta ridotta ad 1/3 (40%) e credo si possa calcolarla relativamente agli ultimi 5 anni. Però io una telefonata all AdE la farei, se non andare allo sportello, giusto per sapere se PER CASO si riuscisse a recuperare l'imposta già versata...
Considerando che ha dichiarato il canone io regolarizzerei questo già esistente prima di farne uno nuovo.

[giulyrob]

ti ringrazio per la risposta